Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC104581.4-201ENST00000623126 3052 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SMC1AQ14683 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms