Protein–RNA interactions for Protein: Q14134

TRIM29, Tripartite motif-containing protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM29Q14134 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TRIM29Q14134 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TRIM29Q14134 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.2 ms