Protein–RNA interactions for Protein: Q13702

RAPSN, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAPSNQ13702 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
RAPSNQ13702 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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