Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC1Q13547 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
HDAC1Q13547 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
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