Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ANXA2R-202ENST00000616064 1265 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP4Q13115 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
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