Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
STRN3Q13033 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
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