Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
NFX1Q12986 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 MIR5189-201ENST00000577370 114 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
NFX1Q12986 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
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