Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SEMA4B-201ENST00000332496 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 LILRB5-203ENST00000449561 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 LINC02346-201ENST00000383019 1967 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CPT1B-202ENST00000360719 2319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 EXO5-201ENST00000296380 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MYD88-201ENST00000396334 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
BNIP1Q12981 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms