Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 FMR1NB-201ENST00000370467 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIN2AQ12879 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
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