Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC092634.8-201ENST00000639687 773 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF718-202ENST00000609714 2772 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CCDC173Q0VFZ6 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms