Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PRSS30P-203ENST00000476276 2855 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PLCB3-202ENST00000325234 3946 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
IFFO1Q0D2I5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
IFFO1Q0D2I5 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms