Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TGM3Q08188 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TGM3Q08188 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TGM3Q08188 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms