Protein–RNA interactions for Protein: Q07864

POLE, DNA polymerase epsilon catalytic subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 2,286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLEQ07864 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLEQ07864 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 NYNRIN-201ENST00000382554 7857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
POLEQ07864 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
POLEQ07864 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms