Protein–RNA interactions for Protein: Q06323

PSME1, Proteasome activator complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME1Q06323 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC106738.2-201ENST00000559802 557 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PSME1Q06323 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PSME1Q06323 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms