Protein–RNA interactions for Protein: Q03923

ZNF85, Zinc finger protein 85, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF85Q03923 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
ZNF85Q03923 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
ZNF85Q03923 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms