Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
NUCB1Q02818 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 FOXRED1-213ENST00000532125 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NUCB1Q02818 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms