Protein–RNA interactions for Protein: Q02577

NHLH2, Helix-loop-helix protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLH2Q02577 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
NHLH2Q02577 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SORCS1-201ENST00000263054 7272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
NHLH2Q02577 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms