Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
DSC2Q02487 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms