Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TFAMQ00059 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms