Protein–RNA interactions for Protein: P78314

SH3BP2, SH3 domain-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2P78314 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SH3BP2P78314 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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