Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HERVK_113P63132 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms