Protein–RNA interactions for Protein: P61009

SPCS3, Signal peptidase complex subunit 3, humanhuman

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPCS3P61009 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SPCS3P61009 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 DKFZP434A062-201ENST00000573103 5021 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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SPCS3P61009 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SPCS3P61009 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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