Protein–RNA interactions for Protein: P59894

DCDC1, Doublecortin domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCDC1P59894 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 S100A16-202ENST00000368704 1146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
DCDC1P59894 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms