Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RAB15P59190 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms