Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSX2P58304 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSX2P58304 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSX2P58304 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
VSX2P58304 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSX2P58304 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSX2P58304 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSX2P58304 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSX2P58304 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
VSX2P58304 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
VSX2P58304 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
VSX2P58304 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
VSX2P58304 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85 ms