Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
LIMK2P53671 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms