Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
COPAP53621 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
COPAP53621 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
COPAP53621 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
COPAP53621 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms