Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AL139339.1-201ENST00000411906 657 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SMARCA4P51532 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 HOXA10-AS-202ENST00000519935 1161 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PUDPP3-201ENST00000445368 636 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC087045.2-201ENST00000606279 1003 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMARCA4P51532 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms