Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
KRT6CP48668 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms