Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
CDKN1BP46527 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.2 ms