Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 NOP2-211ENST00000540228 668 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 BRWD1P1-201ENST00000401091 371 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RANGAP1P46060 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RANGAP1P46060 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms