Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CASP2P42575 KDM6B-201ENST00000254846 6713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CASP2P42575 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms