Protein–RNA interactions for Protein: P36941

LTBR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBRP36941 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
LTBRP36941 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC005901.1-201ENST00000592766 552 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 RPL18P13-201ENST00000478088 569 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
LTBRP36941 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
LTBRP36941 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms