Protein–RNA interactions for Protein: P36871

PGM1, Phosphoglucomutase-1, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGM1P36871 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 ALDH4A1-206ENST00000538839 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PGM1P36871 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGM1P36871 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGM1P36871 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGM1P36871 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGM1P36871 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
PGM1P36871 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PGM1P36871 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms