Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
GJC1P36383 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
GJC1P36383 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
GJC1P36383 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms