Protein–RNA interactions for Protein: P32239

CCKBR, Gastrin/cholecystokinin type B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCKBRP32239 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CCKBRP32239 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CCKBRP32239 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms