Protein–RNA interactions for Protein: P30533

LRPAP1, Alpha-2-macroglobulin receptor-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRPAP1P30533 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LRPAP1P30533 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LRPAP1P30533 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms