Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP5DP30049 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms