Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CASP1P29466 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms