Protein–RNA interactions for Protein: P25800

LMO1, Rhombotin-1, humanhuman

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Length 156 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1P25800 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
LMO1P25800 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
LMO1P25800 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
LMO1P25800 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
LMO1P25800 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
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