Protein–RNA interactions for Protein: P24723

PRKCH, Protein kinase C eta type, humanhuman

Predictions only

Length 683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCHP24723 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PRKCHP24723 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
PRKCHP24723 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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