Protein–RNA interactions for Protein: P24539

ATP5F1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5F1P24539 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATP5F1P24539 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms