Protein–RNA interactions for Protein: P22888

LHCGR, Lutropin-choriogonadotropic hormone receptor, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHCGRP22888 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHCGRP22888 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms