Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TRHP20396 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 PRMT2-216ENST00000621201 1301 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TRHP20396 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRHP20396 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRHP20396 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRHP20396 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRHP20396 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TRHP20396 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 C4orf45-201ENST00000434826 1215 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC024475.1-201ENST00000528480 605 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 LINC01588-216ENST00000623502 975 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TRHP20396 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
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