Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TNNI3P19429 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
TNNI3P19429 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
TNNI3P19429 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
TNNI3P19429 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms