Protein–RNA interactions for Protein: P17707

AMD1, S-adenosylmethionine decarboxylase proenzyme, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMD1P17707 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMD1P17707 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMD1P17707 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMD1P17707 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMD1P17707 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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