Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GSE1-202ENST00000393243 7140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DGKD-201ENST00000264057 6297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TMEM132C-201ENST00000435159 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 LINC02212-201ENST00000515243 2130 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ARHGAP45-206ENST00000586866 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NOTCH1-201ENST00000277541 9371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SGTB-201ENST00000381007 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 IKZF1-202ENST00000343574 5925 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NEFHP12036 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms