Protein–RNA interactions for Protein: O76041

NEBL, Nebulette, humanhuman

Predictions only

Length 1,014 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEBLO76041 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEBLO76041 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 LINC01010-201ENST00000431422 2069 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEBLO76041 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEBLO76041 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms