Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 LINC01475-201ENST00000548010 766 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 PTOV1-214ENST00000600603 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DEPDC5O75140 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms