Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 RPN2-202ENST00000373622 2348 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
KIF1CO43896 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
KIF1CO43896 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms